A Polícia Florestal do Estado de Santa Catarina surgiu a primeira vez em nosso estado pela lei n° 3.147, de 17 de dezembro de 1962, que fixava seu efetivo em Pelotão Florestal. A comando de um 1° tenente, seu efetivo era 37 policiais militares, com sede na cidade de Curitibanos.
Em 1963, a lei n°3406, de 27 de dezembro do mesmo ano, fixava o efetivo da Polícia Florestal, bem como mudava o comando para um capitão combatente.
A Polícia Florestal é extinta em 1979, surgindo novamente pela lei n° 19.237, que atribuía á PMSC o policiamento de mananciais e florestas.
Em 1990, a lei n° 8039, de 23 de julho de 1990, criava a Companhia de Polícia Florestal (CPF), com seu efetivo em 192 homens, sendo suas atribuições definidas na mesma lei.
Através do decreto n° 3.569, de 27 de Março de 1993, a CPF passou a denominar-se Companhia de Polícia de Proteção Ambiental (CPPA) Dr.Fritz Müller, em homenagem ao “Príncipe dos Observadores”, pai da ecologia catarinense.
No dia 14 de setembro de 1994, foi assinado o decreto n°4.815 pelo governador do Estado, cedendo a sede administrativa do Parque Estadual do Rio Vermelho, para que a CPPA pudesse instalar seu comando em suas dependências.
No dia 02 de janeiro de 1995, o comando da CPPA instala-se definitivamente no Parque Estadual do Rio Vermelho, passando a Baixada do Maciambú denominar-se 2° Pelotão de Proteção Ambiental.
Com a crescente demanda e o respaldo da população catarinense, na data de 04 de agosto de 2005, a Companhia de Polícia de Proteção Ambiental passa a ser denominada Guarnição Especial de Polícia Militar Ambiental (GEPMA)
No dia 22 de setembro de 2008, pelo decreto n° 1682, a Guarnição Especial de Polícia Militar Ambiental passa a ser denominada Batalhão de Polícia Militar Ambiental (BPMA), com sede em Florianópolis e desdobrada em sete Companhias.
Em 02 de fevereiro de 2015, o BPMA tem sua sede definitiva inaugurada.
Em 2015, criada pelo Comandante-Geral da Polícia de Santa Catarina, o Comando de Policiamento Militar Ambiental (CPMA), com 19 unidades espalhadas pelo Estado e 384 policiais militares ambientais, sua sede fixou-se no Parque Aventura, Abraão, onde encontra-se atualmente.